公司有笔账要叫同一个集团的下属公司付。合同全是我们公司签订的，那个公司要求写个和那笔账相关的补充协议，说我们公司归他们公司管理，这些账才能走他们公司过，这样写我又觉得不妥，独立的两个公司这种支付，怎样写的关系比较清晰。

合同权力转移协议，三方签字盖章

简单的代收代付而已吧。难道那个公司可以不付么？那就不是简单的代付了。

比如你公司是A，那公司是B，集团是C。

如果不考虑规避兄弟公司间关联交易的问题（主要是如果要上市，这种关联交易很烦人），直接A\B签个协议，由B代A公司支付有关合同款项，财务上A公司挂对B公司其他应付，B公司相应挂对A公司其他应收。

如果要做得更干净，可以通过走集团借款方式把应收应付关系都挂到集团口。即，C代A支付合同价款，B代C支付合同价款。这样A的账上就是欠集团的钱，B的账上就是集团欠自己钱，看上去更合理，也不用在自己的报表上显示出对方公司的痕迹，可以省去很多未来监管的麻烦。

如果是合同主体都变更了，那么A、B公司需要与原协议方签署三方协议，将A在协议中的身份（甲方或乙方）变更为B。

具体问题具体分析，LZ给的信息太少。