1988年7月25日，一辆轻铁列车在青山公路试车时，由于轻铁车长冲红灯，于田厦路平交道与一辆客货车相撞，造成客货车上一名8岁男童死亡；在此致命车祸前，轻铁已发生17宗交通意外，事故后轻铁被政府勒令停止试车，通车日期亦由当年原订的8月8日推迟至9月18日。
1994年7月29日，一辆往屯门码头总站的507线列车，于上午10时在屯门兆禧苑侧，即湖景路与湖山路交界路口(该路口不可转右)与违规转右的空拖架货柜车相撞，轻铁列车车长被抛出车外死亡，另4名乘客受伤，而该辆列车因此报废，拆解作零件用途。
1994年9月10日，一辆往屯门码头总站的614线列车，和一辆往元朗总站的614线列车，在屯门兆康站以北的青麟交汇处的平交道，与一辆满载乘客的冲红灯旅游巴士相撞，旅游巴士司机和1名巴士乘客死亡，另45人受伤。
1996年3月17日，一辆往屯门码头总站的615线列车在兆康站以北的青麟交汇处与货柜车相撞，货柜车司机死亡，列车则冲前40米全车出轨。
1997年6月21日，一辆往屯门码头总站的615线列车在兆康站前右转时与对面路轨往天水围（现天荣站）的720线列车迎头相撞，29人受伤。
2002年12月18日，一辆往兆康站505线列车在驶入兆康站时前轮滑出路轨，导致轻铁由兆康站至洪水桥站的服务局部受阻。
2004年9月10日，一辆往天逸的751线列车，在天荣路右转往天瑞路时，一个车轮爆裂，导致后方转向架出轨，无人受伤。
2008年10月30日，一辆往天逸站的751列车，途至接近友爱路的灯口时，疑因有汽车冲红灯横过轻铁交汇处，751线列车紧急煞车，但尾随一辆往田景站的507线列车收掣不及，从后猛撞751线列车，27人受伤。
2009年1月19日，一辆往天水围站的706线列车，途至至天祥路交通交汇处时拦腰撞向违例右转的士，的士车身严重损毁扭曲，的士司机受伤被困，而轻铁车身轻微撞花，列车上25名乘客无受伤。
2012年6月14日，香港两列轻铁14日晚7时许在元朗洪水桥站因追尾发生轻微碰撞，导致28人受伤，其中1人伤势较重，其余均为轻伤。