DNA相对比较稳定，研究人员提取的DNA可以在溶液中放置数周，如果在零下20℃条件下可以保存数月到1年，如果除去水分，晾干保存，可以放置数年或更长。但是，实验室提取的DNA一般都经历一步“酚:氯仿抽提（或萃取）”过程，这两个有机溶剂都是强烈的蛋白变性溶剂，目的是将所有酶类灭活。这就容易理解为什么实验室提取的DNA那么稳定了，一则除掉了攻击它的酶，二是除去水分。但即使是这样，能放置几千年吗？没人知道。
在自然条件下，DNA可不是那么安全的。DNA储存在细胞核内，生物体在死亡过程中，细胞会逐渐发生自溶，大量酶类如蛋白酶、DNA酶等释放，细胞的DNA很快会被降解，即便是细胞没来得及自溶，但是天长日久，微生物进驻组织或细胞，就像寄居蟹一样，在那里吃喝拉撒，生老病死，它们产生的蛋白酶也会把原细胞内的DNA破坏掉；另外，在高温和潮湿的条件下自身容易发生水解、断裂。因此，一般死亡的动物和人的遗体中，DNA很难完整保存下来。当然，酶对DNA的破坏作用是需要水分的，而且跟温度成正相关，如果能保证绝对干燥，或许能保存得相对时间长些。另外，在个别特殊情况，如在极端寒冷的情况下被冻死的人和动物，这些组织来源的DNA或许能避免降解，或发生得极其慢，还有机会测得其DNA序列。
但是，对于古埃及的木乃伊，似乎有些特殊。木乃伊的制作过程显然对DNA的保存十分有利。首先，在人死亡之后尸体周围大量的，包括碳酸钠盐在内的天然盐分，使尸体快速脱水、变干，减少DNA的降解，避免自发水解；然后干尸上覆盖一层防腐剂，外层再涂上厚厚的隔离材料，主要有沥青、植物油和蜂蜡等，主要作用是防潮和防止空气氧化。上述涂抹材料都深深地渗入身体内部，组织都被染成了黑色，这些材料其实对尸体的DNA形成特殊的保护。当然，这还只是理论推测，究竟如何，要看实际结果。
