据中国新闻网2月22日援引中国科学院西双版纳热带植物园官方网站消息，该园联合华南农业大学和北京脑科中心，收集了全球共享到GISAID EpiFluTM数据库中覆盖四大洲12个国家的93个新冠病毒样本基因组数据(截至2月12日)，通过全基因组数据解析发现：武汉华南海鲜市场的新型冠状病毒是从其它地方传入。

93个样本包含58种单倍型，演化关系显示，单倍型H13和H38是比较“古老的”单倍型，通过一个中间载体(mv1，可能是祖先单倍型，也可能是来自中间宿主或“零号病人”)与蝙蝠冠状病毒RaTG13关联，并通过单倍型H3衍生出单倍型H1。

研究人员称，与华南海鲜市场有关联的患者样品单倍型都是H1及其衍生单倍型H2，H8-H12，而一份武汉样品单倍型H3与华南海鲜市场无关。可见，华南海鲜市场的新冠病毒是从其它地方传入，再在市场发生快速传播并蔓延。另根据病患发病时间记录和种群扩张时间推断，也印证了华南海鲜市场不是病毒发源地的推论。

此外，研究人员对H13和H38的病毒样品溯源发现，分别来自深圳的病患(广东首例)和美国华盛顿州的病患(美国首例)。他们的旅行记录表明都是2019年12月底至2020年1月初在武汉被感染。现有武汉样本中没有检测到H13和H38单倍型。

研究还显示，新冠病毒在2月12日前发生过2次明显种群扩张：一次是2019年12月8日，该结果暗示病毒可能在12月初，甚至11月下旬已开始人际传播，随后在华南海鲜市场加快；另一次种群扩张发生在1月6日。

值得一提的是，为细分来源，研究人员将58种单倍型分成五组，包括3个古老超级传播者单倍型(H1,H3和H13)和2个新的超级传播者单倍型(H56和mv2)。以此鉴别出广东的病毒可能有三个来源，重庆和台湾的病毒有两个来源。有较多样本的澳大利亚、法国、日本和美国，患者感染源至少有两个，尤其是美国包括了五个来源。特别值得关注的是H56这个超级传播者单倍型，同时是澳大利亚、法国和美国以及中国台湾患者的传染源。

研究还表明，新冠病毒基因组没有发生重组事件。https://m.guancha.cn/politics/2020_02_22_537837.shtml

基因研究证实新冠病毒并非来自华南海鲜市场


1月27日，Science在线发表了一篇新闻报道，有研究人员推测新型冠状病毒可能并非源自华南海鲜市场。理由是，最初的一个病例在12月1日患病，但与华南海鲜市场无关。

如今，这个推测被中国科学家最新的基因研究成果所证实。相关研究已发表在中国科学院科技论文预发布平台ChinaXiv。

截止2月12日，中国科学院西双版纳热带植物园联合华南农业大学和北京脑科中心的科研人员一起收集了全世界各领域共享到GISAID EpiFluTM数据库中覆盖了四大洲12个国家的93个新型冠状病毒样本的基因组数据，通过全基因组数据解析，追溯传染源及扩散路径。研究结果发现：

新型冠状病毒并非来自武汉华南海鲜市场

研究收到的93个样本包含58种单倍型，单倍型演化关系显示，单倍型H13和H38是比较“古老的”单倍型，通过一个中间载体（mv1，可能是一个祖先单倍型，可能是来自中间宿主或者“零号病人”）与蝙蝠冠状病毒RaTG13关联，并通过单倍型H3衍生出了单倍型H1。

与华南海鲜市场有关联的患者样品单倍型都是H1及其衍生的单倍型H2、H8-H12，而一份武汉样品单倍型H3与华南海鲜市场无关。可见，华南海鲜市场的新型冠状病毒是从其他地方传入进来，在市场中发生快速传播蔓延到市场之外。

新冠病毒发生过2次明显的种群扩张

根据新型冠状病毒基因组发生重组时间推算，1月之前的种群扩张发生时间是12月8日。这一结果也暗示了，病毒可能在12月初，甚至11月下旬已经开始有人际传播，随后在华南海鲜市场加快了人际传播。

另一次种群扩张发生在1月6日，这可能与元旦假期有关联。也是在这一天，国家疾控中心发布了2级应急响应。当时的预警起到了一些警示作用，公众活动和出行都有所减少。如果当时的警示能引起大众更广泛的重视，那么1月份中下旬向全国和全球蔓延的病例会有所降低。

该研究进一步确认了，我国其他9个省区和其他11个国家的感染病例基本都是从武汉直接或者间接输入而来。

现扩散的病例至少来自于3个途径

为了能够细分来源，研究人员将58种单倍型分成了五组，包括3个古老超级传播者单倍型（H1, H3和H13）和2个新的超级传播者单倍型（H56和mv2）。

以此鉴别出广东的病毒可能有三个来源，重庆和中国台湾的病毒有两个来源。其中，广东深圳一家人在早期就通过人传人进行了传播。澳大利亚、法国、日本、美国的样本相对较多，这些患者感染源至少有两个，而美国甚至包括了五个来源。

特别值得关注的是H56这个超级传播者单倍型，它同时是澳大利亚、法国、美国，以及中国台湾患者的传染源。

相关论文信息：http://www.chinaxiv.org/abs/202002.00033

http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2020/2/436077.shtm

我就想知道最后会不会跟MH370一样没人出来说真话！！！

还是让米国专家来看看吧 国内艺术特长生水平不够 iOS fly ~

中间这句话，11月底开始传播的这句。。我跟身边一个武汉医务工作亲戚年前打电话问的时候，她就说过有这个怀疑了，但是木有时间和资源去研究都在忽悠和填坑

最早的一篇论文就说了第一个病人是12月1日

回复5#tuzky


是的，我听说也是那个时间，没觉得多大事

现在纠结这个有啥用？ iOS fly ~

病毒来源很重要 搞清楚传播路径才能有效控制