原标题：H7N9病毒基因3个已移位再移一个就人传人
浙江在线04月27日讯 人感染H7N9病毒的感染源果真是鸡等家禽，其铁板钉钉的证据已经找到了；让人最为关注与担忧的“人传人”悬念也有了端倪：病毒的基因如一部旋转楼梯，如果各个台阶稳定，传染性就不明显。但目前已发现其中3个“台阶”的位置发生了变化，假如再有一个“台阶”移位，就会破坏“楼梯”的稳定性，那么这个病毒就会导致“人传人”了。
“希望第四个台阶发生移位的可怕结果不会出现！我们会密切关注，尽可能地提前预警。”昨日在浙大一院召开的新闻发布会上，李兰娟院士充满信心地说。
从发布会上，记者获悉，李兰娟院士为首的中国科学家在H7N9禽流感研究方面取得了重大突破，论文《人类感染活禽市场来源的新发H7N9亚型禽流感病毒：临床分析和病毒基因组特征》，已在世界著名医学期刊《柳叶刀》在线发表。
该论文对H7N9新病毒的基因，疾病的传染源，以及病毒传播方式等热点问题有了新的解读。给我国H7N9的防控以及国际流感研究都添上了重要一笔。
感染源锁定“禽类”
拿到了基因证据
在《柳叶刀》在线发表的这篇H7N9研究论文中，李兰娟院士是通讯作者，其他作者还包括了浙大一院和香港大学两地国家重点实验室的临床及科研专家，凝聚了团队研究的力量。
“长三角”发现H7N9病例以来，一方面政府关闭了活禽市场，许多农贸市场看不到鸡鸭了，市民也不敢吃了；另一方面，近40%的确诊病人却找不到接触过鸡鸭的流行病学史，那么鸡鸭到底是不是H7N9的传染源？这篇文章首次在国际上拿出了证据：H7N9病毒就是从禽类向人类传播的。
李兰娟院士介绍说，我们对患者体内分离出的H7N9病毒，与活禽市场的鸡中分离出的H7N9病毒株进行遗传学比较，研究发现，毒株之间的基因序列非常接近，同源性超过99.4%。
监测人传人
找到有效方法
H7N9病毒是2011年从韩国的野鸭身上分离发现的。今年3月，它从禽类“跳”到哺乳动物和人身上，那么H7N9病毒会不会在哺乳动物之间来去自由，导致人际间的传播扩散？
这篇论文是这样回答这个问题的：
如其他病毒一样，H7N9有它特有的基因序列。如果把H7N9病毒的基因序列比喻成一条长长的楼梯，那么不同的基因和位点，就好像是其中的台阶和其定位。
此次研究发现了其中4个“台阶”及定位是关键，如果它们突然改变，那么人传人将成事实。研究发现，有个H7基因里的2个氨基酸位点已发生了“移位”，相当于2个台阶位置变了，这意味着病毒与人类呼吸道上皮细胞的亲和力增强了，所以今年春天，H7N9从禽传给人变得轻而易举了。
但能否人传人，关键还得看另外一个PB2基因，这基因也有2个氨基酸位点。目前，科研团队已发现它们中，1个位点已发生变异，要高度警惕的是，如果这2个氨基酸位点同时发生变异，将使病毒发生有效的人向人传播。
“这个可能性大吗？”记者问。
李兰娟说，以往的H5N1及其他甲流病毒中，这位点没有发生过变异。不过，不等于说它以后在H7N9中也不可能，因此需要密切关注。
H7N9病毒“嗜肺”
原因也找到了
临床研究还发现，H7N9禽流感感染者的症状与H5N1禽流感大致相似，患者出现高烧和呼吸困难等症状，随后的3~14天内出现呼吸衰竭。
也就是说，H7N9病毒的确“嗜肺”。其原因在研究中有了新的揭示。研究者发现，重症感染患者中普遍存在“细胞因子风暴”现象，这种现象导致了肺被病毒大量侵蚀。找到原因之后，研究者又在临床治疗中，创造性地应用人工肝技术，来清除炎症因子，抑制炎症反应，避免了大规模的“细胞因子风暴”，帮助患者渡过器官功能衰竭难关，从而降低了病死率。


http://news.ifeng.com/mainland/special/h7n9/content-3/detail_2013_04/27/24730034_0.shtml

啥，连这个都是棒子的了……

人传人 的概率多大

已被14L干货击沉,是我胡乱评论专家结论了。
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研究发现，毒株之间的基因序列非常接近，同源性超过99.4%。

艹，这SB专家知道人和猩猩的基因相似度是多少吗？

本帖最后由 分不清雨水泪水 于 2013-4-27 14:08 通过手机版编辑

键盘科学家，知道《柳叶刀》是什么不？

我再仔细看了一下这个新闻，确定说话的这位是院士。您老果然牛逼，院士也成了SB专家了啊。

建议专家研究一下您和猩猩的基因相似度

已被14L干货击沉
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“长三角”发现H7N9病例以来，一方面政府关闭了活禽市场，许多农贸市场看不到鸡鸭了，市民也不敢吃了；另一方面，近40%的确诊病人却找不到接触过鸡鸭的流行病学史，那么鸡鸭到底是不是H7N9的传染源？这篇文章首次在国际上拿出了证据：H7N9病毒就是从禽类向人类传播的。
李兰娟院士介绍说，我们对患者体内分离出的H7N9病毒，与活禽市场的鸡中分离出的H7N9病毒株进行遗传学比较，研究发现，毒株之间的基因序列非常接近，同源性超过99.4%。

患者体内分离出的H7N9病毒，与活禽市场的鸡中分离出的H7N9病毒株 ，同源性超过99.4%
得出结论
H7N9病毒就是从禽类向人类传播的，近40%的确诊病人却找不到接触过鸡鸭的流行病学史，是这40%肯定也接触过，没调查出来

我喷的是此专家这个推导过程。

人和猩猩相似度是98以上，可是差别极大。
所以用毒株相似99.4就推出“H7N9病毒就是从禽类向人类传播的”这个结论，起码是不严谨的。

话说完了，各位继续随便喷

本帖最后由 分不清雨水泪水 于 2013-4-27 14:08 通过手机版编辑

实际上文中根本没提到相似度的数值，而是用了另一个值：同源性。
你大概是以为她说两者基因相似度为99.4%，实际上根本没说这个

这是我今年看过最好笑的回复。。

你觉得把论文贴新闻上你就能看懂了么

差别极大？没看出来啊。。。

然后，作为化工出身的人我也说不出个所以然，所以放了次狗
come fromhttp://www.cbi.pku.edu.cn/chines ... verview/web3/2.html
相似性和同源性

如上所述，数据库搜索的基础是序列的相似性比对，而寻找同源序列则是数据库搜索的主要目的之一。所谓同源序列，简单地说，是指从某一共同祖先经趋异进化而形成的不同序列。必须指出，相似性(similarity)和同源性(homology)是两个完全不同的概念。相似性是指序列比对过程中用来描述检测序列和目标序列之间相同DNA碱基或氨基酸残基顺序所占比例的高低。当相似程度高于50%时，比较容易推测检测序列和目标序列可能是同源序列；而当相似性程度低于20%时，就难以确定或者根本无法确定其是否具有同源性。总之，不能把相似性和同源性混为一谈。所谓“具有50%同源性”，或“这些序列高度同源”等说法，都是不确切的，应该避免使用。

相似性概念的含义比较广泛，除了上面提到的两个序列之间相同碱基或残基所占比例外，在蛋白质序列比对中，有时也指两个残基是否具有相似的特性，如侧链基团的大小、电荷性、亲疏水性等。在序列比对中经常需要使用的氨基酸残基相似性分数矩阵，也使用了相似性这一概念。此外，相似性概念还常常用于蛋白质空间结构和折叠方式的比较。

病毒基因复杂程度根本不能跟人类和猩猩相比吧，说不定这种相似度在病毒领域就是决定性的证据呢？

你就说你是不是资深基因或者病毒的专家吧，我觉得对自己不了解的领域胡乱评论是一种太有勇气的行为。

Got it.
被干货击沉了。泪流满面。

好朋友的老妈。。他老爸也挺厉害的

我就记得人和猩猩的遗传物质是dna，病毒的遗传物质是rna，这两种东西没法比吧？

我恨生物，当年要不是高考生物那24分，也不用去操蛋大学了

李兰娟院士充满信心地说
希望能有信心击退病毒