全球新冠病毒基因组系谱图说明了什么?

  • m
    momogrant
    https://nextstrain.org/ncov/zh

    此系统发生显示新的冠状病毒(nCoV)COVID-19流行病毒的进化关系。 所有样品相对于一个共同祖先与最多八个突变高度相关,表明在2019年11月至12月某个时间共有一个共同祖先。这表明2019年11月至12月初次人类感染,随后持续的人对人传播导致 采样感染。

    站点编号和基因组结构使用Wuhan-Hu-1/2019 作为参考。 系统发育植根于武汉的早期样品。 时间分辨率假定每个位点每年的核苷酸取代率为5 × 10^-4个。有关生物信息处理的完整详细信息。

    SARS相关β-冠状病毒中nCoV的系统发生背景。

    我们非常感谢作者,他们通过本研究所基于的GISAID提供了遗传序列和元数据的实验室,并为此提交了实验室。 以下是所有原始实验室和提交实验室的完整列表。 通过单击页面底部的“下载数据”,然后在出现的对话框中单击“应变元数据”,可以使用归因表。
  • k
    ktv88808
    看这个病毒发展的树状结构,突然想起一个人类进化基因丰富性相关的东西。

    病毒从源头开始,越进化种类越多,也就是基因丰富性越来约大?

    而分子人类学,研究人类遗传方面却说的是因为非洲人群基因种类更丰富,所以非洲是人类起源?

    这个让我这个科盲有点儿困惑了。

    到底是基因种类更丰富的一面是源头,还是基因种类更单一的一面是源头呢?

    求解惑~~

  • z
    zo
    非洲是人类起源,这个不是看人的遗传dna的,是看的线粒体dna。

    线粒体dna很稳定,以极慢的速度变化,分析全球各个人类线粒体dna的变化,就追溯到二十万年前的一个非洲女性身上。所有即存的人类身上的线粒体都来自于这个女性。她被称为是线粒体夏娃
  • k
    ktv88808
    怎么确定的这位夏娃是在非洲?
  • t
    tit
    起先,人类在非洲,进化了10万年,有了一定的“丰富性”,设为A1。
    然后,这些在非洲的人中的一小群,走出非洲。这一小群人,他们的多样性此时约等于零,设为B1。B1远远小于A1。

    再过10万年,到了现在,A1变成了A2,B1变成了B2。B2还是小于A2。同时代横向在比较。

    而你举的病毒,是在比较A2和A1。或是在比较B2和B1,是在纵向在比较。
  • l
    lvcha
    在非洲挖出来的吧
  • t
    tit
    或者这么说,假设病毒在武汉进化出好几个分支,其中一个分支跑出湖北,传染到全世界。这样看,湖北的基因多样性就比外面的更丰富了。这就是人类走出非洲的故事。
  • k
    ktv88808
    虽然扔没转过弯儿来,还是感谢分享,我在仔细琢磨琢磨。
  • z
    zo
    查了全球各个人种的线粒体,发现非洲裔群的线粒体突变最多,线粒体突变的速度又比较稳定和缓慢,所以就说明非洲人的线粒体最为古老。往上追溯到唯一的原型上,就是一个非洲女性。
    为什么是女性而不是男性,因为线粒体只会从母亲方遗传下来。
  • c
    coolwind
    想到了寄生前夜的剧情